GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BTM6079 | AKUATİK CANLILARDA SİTOGENETİK VE KARYOTİP | Ders | 1 | 1 | 6.00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
[DersinAmaci]
Deniz ve içsularda yaşayan yumuşakçalar, kabuklular vb. akuatik organizmaların kromozomların yapısı ve sayısının belirlenmesinde in vitro metotların geliştirilmesi, kromozom preparatlarının hazırlanması, boyama-bantlamaların yapılması ve incelenmesi, karyotiplerinin çıkarılması hakkında tekniklerin gösterilmesi.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi / Görevlileri
Dr. Öğretim Üyesi Serkan SAYGUN
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Akuatik yumuşakça ve kabuklularda kromozom inceleme üzerine teorik ve pratik bilgileri öğrenir |
| 2 | Sucul türler üzerine sitotaksonomik çalışmaları yapabilir. |
| 3 | Sistematik ve taksonomik çalışmalarda yumuşakçalar ve kabuklular gibi diğer türlerin ayırt edilmesinde yardımcı teknik olarak kromozom tespit edebilir ve karyotip çıkarabilir. |
Öğrenim Türü
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Bu ders akuatik organizmaların kromozomları ve organelleri üzerine bilgiler, kromozomlarındaki sayısal ve yapısal mutasyonları ortaya çıkarmak gibi sitogenetik uygulamalarından, bu canlılarda kromozom tespitinde kullanılan dokular, preparatların hazırlanması ve boyama-bantlama teknikleri, preparatların mikroskopta incelenmesi gibi sitogenetik laboratuvar uygulamalarından oluşmaktadır.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Akuatik organizmalarda Sitogenetiğe giriş | Akuatik organizmalarda yapılan çalışmalara örnekler ve bunların metodolojik incelemesi | |
| 2 | Akuatik organizmalarda Kromozomlar: morfolojik yapıları ve özellikleri | Çeşitli sucul organizma türüne ait kromozomların mikroskopta gösterimi | |
| 3 | Akuatik organizmalarda görülen kromozomal mutasyonlar: Sayısal ve Yapısal kromozom değişimleri | Bazı sucul organizma türlerinden tespit edilen kromozom mutasyonlarının gösterimi | |
| 4 | Yumuşakçalarda kromozom inceleme tekniklerine giriş: kromozom tespitinde doku özellikleri ve seçimi | Bazı yumuşakçalardan direkt inceleme tekniğinin uygulaması | |
| 5 | Yumuşakçalarda sitogenetik çalışmalarda in vivo metotlar | Bazı yumuşakça türlerinin örneklendikten sonra mitotik tetikleyici ve inhibitör uygulaması, yumuşakça dokularının çıkarılması, hipotonizasyon ve fiksasyon işlemleri | |
| 6 | Yumuşakçalarda sitogenetik çalışmalarda in vitro metotlar | Çeşitli yumuşakçalardan doku çıkarılması, doku hücrelerinin büyütülmesi, mitotik inhibisyon, Lam preparasyonu teknikleri | |
| 7 | Yumuşakçalarda sitogenetik çalışmalarda lam preparatlarına uygulanan geleneksel boyama ve bantlamalar, | Bazı mollusk örneklerinden elde edilen lam preparatlarına Giemsa, C, ve NOR uygulama teknikleri | |
| 8 | Arasınav | ||
| 9 | Kabuklularda sitogenetik çalışmalarda in vivo metotlar | Bazı kabuklu türü örneklerinde kromozom tespitinde doku özellikleri ve seçimi; mitotik inhibitörler ve uygulamaları | |
| 10 | Kabuklularda sitogenetik çalışmalarda in vitro metotlar | Bazı kabuklu türlerinin doku hücrelerinin büyütülmesi için kısa süreli ve uzun süreli hücre kültürü tekniğini gösterimi | |
| 11 | Kabuklularda sitogenetik çalışmalarda in vitro metotlar: Kromozom yayma ve preparat yapma teknikleri | Bazı kabuklu türlerinden elde edilen doku hücrelerinden lam preparasyonu tekniği gösterimi | |
| 12 | Yumuşakça ve kabuklularda rutin kromozom boyama uygulamaları ve diğer bantlama yöntemleri | ||
| 13 | Genel mikroskopik incelemeler ve kromozom sitelerinin tespiti, dijital olarak mikrofotoğraflama | Mikroskopta kromozomların belirlenmesi, en iyi metafaz sitelerinin tespiti, görüntülerin dijital ortama aktarılması, metafaz resimlerinin incelenerek sınıflandırılması | |
| 14 | Diğer sucul organizmalarda in vivo sitogenetik metotlar: Hücre kültürü ve direkt preparasyonlar | Diğer bazı sucul hayvansal organizmalar örneklerinde kromozom tekniklerinin uygulaması | |
| 15 | Sitogenetik sonuçların değerlendirilmesi: Resim analiz programları, Kromozom boylarının ölçümü, sayımı, karyotip ve ideogram çıkarma | Kromozom sayımlarının yapılması, çeşitli görüntü analiz programlarında kromozom boylarının ölçümü, karyotipleme vd işlemlerin gösterilmesi | |
| 16 | Yarıyılsonu sınavı |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
1 Ulupınar, M ve Alaş, A., 2002. Balık Sitogenetiği ve Laboratuvar tekniği (Ders Kitabı). 371s. 2 Denton, T.E., 1973. Fish Chromosome Methodology, Charles C. Thomas Publisher, NewYork, 166 p. 3 Pisano, E., Ozouf-Costaz, C. and F. Foresti, 2007. Fish Cytogenetic. Science Publishers, 518p. İlave Kaynak 4 Sharma, A.K. and A. Sharma, 1980. Chromosome Techniques: Theory and Practice, Butterworth & Co. Ltd., 699p. 5 Schreck, C. B. and Moyle, P. B., 1990. Methods for Fish Biology. American Fisheries Society, Bethesta, Maryland, USA, 684p. 6 Bernard, J., 1974. Animal Cytogenetics. Vol. 4: Chordata 1: Protochordata, Cyclostomata and Pisces. Gebrüder Borntraeger, Berlin, Stuttgart, Germany, 87p.
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 4 | 56 |
| Laboratuvar | 10 | 4 | 40 |
| Bireysel Çalışma | 10 | 2 | 20 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 10 | 3 | 30 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 10 | 3 | 30 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 180 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| [PC] 1 | [PC] 2 | [PC] 3 | [PC] 4 | [PC] 5 | [PC] 6 | [PC] 7 | [PC] 8 | [PC] 9 | [PC] 10 | [PC] 11 | [PC] 12 | |
| [OC] 1 | 4 | 3 | 2 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 | 2 |
| [OC] 2 | 3 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 |
| [OC] 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek